Nepal'in tür çeşitliliği ülkenin son derece çeşitli iklimi ve topografyasına atfedilebilir. Bu nedenle Nepal, çok çeşitli bitki ve hayvanlarla kutsanmıştır. Nepal Florası ve Faunası, yalnızca Nepal'de bulunan Dikenli Babbler (Turdoides nipalensis) dahil olmak üzere yaklaşık 868 kuş türüne (Nepal kuş gözlemcileri için faydalı bir web sitesi www.birdlifenepal.org'dur), 650'den fazla kelebeğe (ve ayrıca 3,900 aydan fazla) ve yaklaşık 6,500 çiçekli bitkiye sahiptir. Kelebekler (putali) Mart ve Nisan aylarında ortaya çıkar ve Mayıs ve Haziran aylarında bol miktarda bulunur. En az altı kelebek türler Nepal'e özgüdür, yani yalnızca Nepal'de bulunduğuna inanılıyor.
1998 ve 2008 arasında, 353 yeni tür Doğu Himalaya'da (Nepal, Bhutan, kuzeydoğu Hindistan, kuzey Burma ve güney Tibet'i kapsayan) bildirildi. Keşifler arasında 242 bitki, 16 amfibi, 16 sürüngen, 14 balık, iki kuş, iki memeli ve 61 omurgasız yer alıyor. Kuşlardan, Sykes'ın gece kuşu (Caprimulgus mahrattensis), Ocak 2008'de Koshi Tappu Yaban Hayatı Koruma Alanı'nda keşfedildi.
Ovalarda, örneğin Chitwan Milli Parkı, subtropikal ormanlar en önemli tür sayısını destekler. Hint alt kıtasının en büyük memelilerinden bazıları burada bulunabilir, bunlar arasında büyük tek boynuzlu veya Hint gergedanı (Rhinoceros unicornis) ve kaplan (Panthera tigris) bulunur. Dünya Yaban Hayatı Fonu (WWF) yakın zamanda tahmin etti ki Terai'nin dört korunan alanında 121 yetişkin kaplan.) Ülkenin ova otlaklarının yalnızca küçük alanları kaldı ve neredeyse hepsi korunan ormanlık alanlar içinde yer alıyor. Bataklık geyiği, büyük tek boynuzlu gergedan ve dünyanın en tehlike altındaki toy kuşlarından ikisi olan Bengal ve Küçük Florican dahil olmak üzere birkaç tehdit altındaki hayvan için olmazsa olmazdırlar.
Diğer uçta, en az türe ev sahipliği yapan alpin bölgesindeki yüksek zirvelere doğru. İlkbahar ve yaz aylarında, alpin çayırları çiçek açan canlı bir halıya sahiptir. Birçok memeli, örneğin baral veya mavi koyun ve ortak horal (keçi ve antilopa benzeyen bir tırnak toynaklı), otlamak için yüksek otlaklara bağımlıdır. Buna karşılık, nadiren görülen ve tehdit altındaki hayvanların hayati avıdırlar kar Leoparı (Panthera uncia), tahmini Nepal nüfusu 300-400'dür, dünya nüfusunun yaklaşık %10'udur (hayvanat bahçelerindeki 600 kişi hariç). Kuşların aksine, vahşi memelileri (jaanawar) Nepal'de görmek genellikle zordur. Birçoğu sadece geceleri aktiftir.